慢性細菌性前列腺炎在致病菌種類方面與急性細菌性前列腺炎基本相同，二者細菌病原學方面的的差別在于，慢性細菌性前列腺炎病人的前列腺液中細菌的數目較少。
發病原因
與急性細菌性前列腺炎一樣，致病菌為革蘭氏陰性需氧菌，如大腸桿菌和綠膿桿菌，某些臨床學家則認為革蘭氏陽性細菌(如葡萄球菌，鏈球菌，類白喉菌)也可引起前列腺炎，但與革蘭氏陰性菌引起的前列腺感染不同，革蘭氏陽性菌引起的前列腺感染很少遷延不愈或導致感染反復發作，除腸球菌引起的前列腺炎例外，但也有許多作者對革蘭氏陽性菌引起慢性前列腺炎持懷疑態度，目前有證據表明衣原體，支原體也可引起前列腺感染，但較少見。
病原學特點
在前列腺液的細菌培養中有可能需要數天甚至數月才能得到陽性結果，這個特點一方面使得慢性細菌性前列腺炎與急性細菌性前列腺炎相比臨床上存在著較大的不一樣;另一方面，這種低細菌濃度的狀況也使抗菌藥物的效用及機體自身免疫吞噬作用的效率大大降低，因而增加了診斷的難度。
解剖特點
在解剖結構上，前列腺的腺管進入前列腺的四周帶，使尿液輕易進入前列腺，與此伴隨必然影響前列腺液順利地進入尿道。此外，前列腺四周帶發生炎癥所導致的水腫可壓迫導管進一步阻礙前列腺液的排出。在這種狀況下，被傳染物質的堆積和阻塞導致了腺管內的纖維組織沉積以及結石的產生，從而促進慢性炎癥的發生和進展。
分泌功能障礙
前列腺的分泌功能障礙也被以為是細菌性前列腺炎，特殊是慢性細菌性前列腺炎的發作機理之一。盡管前列腺液的pH在正凡人中能夠是酸性或堿性的，但在慢性細菌性前列腺炎病人中均是堿性的。鋅存在于正凡人的前列腺液中，并且是抗菌因子的重要成分，而它在慢性細菌性前列腺炎病人中水平很低，這可能在慢性細菌性前列腺炎的發作中起到了重要酢用。
總之，慢性細菌性前列腺炎會給男性的身體健康帶來危害，導致男性朋友不能正常的工作和生活，影響到性生活質量，甚至會造成精子不液化，精子活動的能力下降，導致不育癥，所以男性朋友一旦發現細菌性前列腺炎就應及時的去正規醫院診治。