(一)化學治療
分化型甲狀腺癌對化療反應差，僅有選擇的和其他治療方法聯用于一些晚期局部無法切除或遠處轉移的病人。以阿霉素最有效，反應率可達30%～45%，可延長生命，甚至在癌灶無縮小時長期生存。相比而言，未分化癌對化療則較敏感，多采用聯合化療，常用藥物，阿霉素(ADM)環磷酰胺(CTX)，絲裂霉素(MMC)，長春新鹼(VCR)，如COA方案CTX0.8d1VCRl.4mg/m2d1d8,ADM 30～40mg/m2dl。每2l天l周期。
(二)內分泌治療
甲狀腺素能抑制TSH分泌，從而對甲狀腺組織的增生和分化好的癌有抑制作用，對乳頭狀癌和濾泡狀癌有較好的治療效果。因此，在上述類型甲狀腺癌手術后常規給預抑制TSH劑量甲狀腺素，對預防癌有復發和轉移灶的治療均有一定效果，但對未分化癌無效。中國國內一般每天用干燥甲狀腺片80～120mg，以維持高水準的甲狀腺激素的水平。