引起排卵障礙的原因有很多，如內分泌紊亂、卵巢病變及全身性疾病等。
一、內分泌紊亂
下丘腦-垂體卵-卵巢功能紊亂可以引起無排卵型月經、月經不調、閉經等導致排卵障礙。
二、卵巢病變
卵巢病變如先天性卵巢發育不全癥、多囊卵巢綜合癥、卵巢功能早衰、功能性卵巢腫瘤、卵巢子宮內膜異位囊腫等，也會導致排卵障礙。
三、全身性疾病
患者重度營養不良、甲狀腺功能亢進等，都會影響卵巢功能導致排卵障礙。
四、其他原因
1、體重
肥胖或者過瘦都會干擾內分泌系統的協調，控制體重有助于預防和治療排卵障礙。
2、飲食
富含咖啡因的飲料，如咖啡、濃茶、可樂等對不孕的影響雖然尚未有一致的結論，但一般建議不宜過量。另外，吸煙、飲酒，不論男女都會影響生育力，所以在要孩子時應該戒掉，同時飲食上避免攝入太多的高熱量食物。這些都有可能導致排卵障礙。
3、月經周期的變化
正常的周期大約25—35天，接近排卵期時，陰道會有少許分泌物。如果經期總是拖延，甚至幾個月一次，或者總是不準時，應及早就醫。否則可能引起排卵障礙。