在現代社會當中，腦炎后遺癥疾病的患者隨處可見，由于很多人對于腦炎后遺癥的發病原因都不是很了解，所以在生活當中沒有及時做好預防工作，而遭到疾病的痛苦折磨，因此主要是由于哪些原因造成了這種疾病的發生呢?
1、環境原因：環境的或職業性地暴露于鉛、一氧化碳或某一化學物質。使用某些藥物或過量酒精攝入。缺乏睡眠、應激、或激素改變。停用某些抗憂郁和抗焦慮藥物。
2、遺傳原因：在不同的家族里已發現有許多類型腦炎后遺癥，并且有些家族被檢測出某一特殊基因異常。這些基因異常可導致人體內鈣、鉀、鈉以及其他其他化學物質代謝細微的改變。遺傳因素通常不是直接引發腦炎后遺癥因，但會間接影響疾病發展。基因能影響患者藥物代謝途徑，或者可導致大腦局部神經元畸形。
3、顱腦損傷：顱腦損傷可以導致腦炎后遺癥發作，如果顱腦損傷較嚴重，發作可能在近幾年就會發生。而如果損傷是輕微的，發作的危險就會比較小。
4、其他疾病：引起腦損害的疾病往往也是腦炎后遺癥的原因。有時通過治療原發病可以阻止腦炎后遺癥發展。但也有病例，原發病治愈后仍繼續發生發作?！“l作是否能停止取決于原發病的類型、受侵襲腦組織的部位以及腦損害的程度。