臨床表現為長期慢性、或反復發作的腹痛、腹瀉及消化不良等癥，重者可有黏液便或水樣便。

　　腹瀉程度輕重不一，輕者每日排便3～4次，或腹瀉便秘交替出現;重者可每1～2小時一次，甚至出現大便失禁。部分患者可有夜間腹瀉和(或)餐后腹瀉。直腸嚴重受累時，可出現里急后重感。糞質多呈糊狀，混有大量黏液，常帶膿血。

　　部分患者便鮮血，其病變限于直腸，稱出血性直腸炎，血液或大便分開排出，或附著于正常或燥糞表面，常被誤認為是痔出血。直腸炎患者亦常排黏液血便，甚至出現大便失禁。病變若擴展至直腸以上，血液往往與糞便混合或出現血性腹瀉。

　　查體可見臍周或下腹部輕度壓痛、腸鳴音亢進、脫肛。

　　一、慢性腸炎的癥狀

　　1.體征發面

　　患者的腹部會出現長期的不適或者在少腹部會有隱痛發生，查體時會發現以肚臍周圍和少腹部及腹部為主。

　　2.全身癥狀

　　患者會有精神不振面色不華以及不愿說話、四肢無力等癥狀表現。還可能出現怕冷，如果是在急性炎癥期，還會發生失水或者是酸中毒后者發熱，甚至還可能出現休克出血。

　　3便血

　　程度較輕的可能是血液附在表面，嚴重的會出現鮮血下流，這很容易導致患者出現休克。

　　4.消化道癥狀

　　常呈現間斷性腹部隱痛、腹脹、腹痛、腹瀉為本病主要表現。遇冷、進油膩之物或遇情緒波動、或勞累后尤著。大便次數增加，日行幾次或數十余次，肛門下墜，大便不爽。慢性腸炎急性發作時，可見高熱、腹部絞痛、惡心嘔吐、大便急迫如水或粘凍血便。

　　5. 腹瀉

　　該病出現的最主要的癥狀就是腹瀉了，一般還是反復發作或者持續得不到治愈。情況較輕時一般每天會出現兩到五次，一般大便都是帶有黏液和膿血。

　　二、慢性腸炎的并發癥

　　1.腸穿孔

　　腸穿孔多為中毒性腸擴張的并發癥，也可出現嚴重型，多發生于左半結腸，皮質激素的應用被認為是腸穿孔的一個危險因素。

　　2.中毒性腸擴張

　　中毒性腸擴張臨床表現為病情迅速惡化，中毒癥狀明顯，伴有腹瀉、腹部壓痛和反跳痛，腸鳴音減弱或消失，白細胞數增多，易并發腸穿孔。

　　3.腸狹窄

　　腸狹窄多發生在病變廣泛、病程持續長達5-25年以上的病例，其部位多見于左半結腸，乙狀結腸或直腸，臨床上一般無癥狀，嚴重時可引起腸阻塞，在本病出現腸狹窄時，要警惕腫瘤，鑒別良性惡性。

　　4.結腸癌

　　慢性腸炎大約有5%病例發生癌變，多見于病變累及全結腸，幼年起病和病史超過10年者。