(一)診斷

　　具有持續或反復發作腹瀉和粘液膿血便、腹痛、里急后重，伴有(或不伴)不同程度全身癥狀者，在排除細菌性痢疾、阿米巴痢疾、慢性血吸蟲病、腸結核等感染性腸炎及克羅恩病、缺血性腸炎、放射性腸炎等非感染性腸炎基礎上，具有上述結腸鏡檢查重要改變中至少l項及粘膜活檢組織學所見可以診斷本病(沒條件進行結腸鏡檢查，而X線鋇劑灌腸檢查具有上述X線征象中至少1項，也可以診斷本病，但不夠可靠)。如果臨床表現不典型而有典型結腸鏡檢查表現及粘膜活檢組織學所見(或典型X線鋇劑灌腸檢查表現)者也可診斷本病;有典型臨床表現或典型既往史而目前結腸鏡檢查或X線鋇劑灌腸檢查無典型改變，應列為"疑診'隨訪。應強調，本病并無特異性改變，各種病因均可引起類似的腸道炎癥改變，故只有在認真排除各種可能有關的病因后才能作出本病診斷。一個完整的診斷應包括其臨床類型、病情嚴重程度、病變范圍、病情分期及并發癥。

　　(二)鑒別診斷

　　1.慢性細菌性痢疾常有急性菌痢病史，糞便檢查可分離出痢疾桿菌，結腸鏡檢查時取粘液膿性分泌物培養的陽性率較高，抗菌藥物治療有效。

　　2.阿米巴腸炎病變主要侵犯右側結腸，也可累及左側結腸，結腸潰瘍較深，邊緣潛行，潰瘍間的粘膜多屬正常。糞便或結腸鏡取潰瘍滲出物檢查可找到溶組織阿米巴滋養體或包囊。血清抗阿米巴滋養體抗體陽性。抗阿米巴治療有效。

　　3.血吸蟲病有疫水接觸史，常有肝脾大，糞便檢查可發現血吸蟲卵，孵化毛蚴陽性，直腸鏡檢查在急性期可見粘膜黃褐色顆粒，活檢粘膜壓片或組織病理檢查發現血吸蟲卵。免疫學檢查亦有助鑒別。

　　4. 克羅恩病(Crohn病)克羅恩病的腹瀉一般無肉眼血便，結腸鏡及X線檢查病變主要在回腸末段和鄰近結腸且呈非連續性、非彌漫性分布并有其特征改變，與潰瘍性結腸炎鑒別一般不難。但要注意，克羅恩病有時可表現為病變單純累及結腸，此時鑒別診斷十分重要，因為兩者在治療反應和預后上有所差異，最重要的是當需要考慮手術治療時，術式選擇有很大差異。例如全結腸切除加回腸肛門小袋吻合術僅適用于潰瘍性結腸炎而不適用于克羅恩病，該術式對前者為根治性治療，而用于后者則術后回腸吻合口復發率非常高。潰瘍性結腸炎與結腸克羅恩病的鑒別要點是：潰瘍性結腸炎病變從肛端直腸開始逆行向上擴展，病變呈連續性和彌漫性，極少數病例可見回腸末段數厘米內粘膜炎癥改變但無潰瘍形成。如見直腸不受累的結腸病變、病變腸段間有正常粘膜的腸段(非連續性)、縱行潰瘍間有正常周圍粘膜(非彌漫性)則為克羅恩病特征;廣泛的肛周病變、瘺和腹腔膿腫僅見于克羅恩病;腸腔明顯狹窄多見于克羅恩病;活檢如見非干酪樣肉芽腫支持克羅恩病診斷。然而，即使仔細鑒別，仍有少部分(西方文獻報道約10%)結腸IBD無法肯定分類，此時稱為未定型結腸炎(indeterminatecolitis)，可能要經過長期隨訪才能作出判斷。

　　5.大腸癌多見于中年以后，直腸指檢常可觸到腫塊，結腸鏡與X線鋇劑灌腸檢查對鑒別診斷有價值，活檢可確診。須注意潰瘍性結腸炎也可引起結腸癌變。

　　6.腸易激綜合征糞便有粘液但無膿血，顯微鏡檢查正常，結腸鏡檢查無器質性病變證據。

　　7.其他其他感染性腸炎(如腸結核、沙門菌結腸炎、耶爾森菌腸炎、空腸彎曲菌腸炎、抗菌藥物相關性腸炎、真菌性腸炎等)、缺血性結腸炎、放射性腸炎、膠原性結腸炎、白塞病、結腸息肉病、結腸憩室炎等應和本病鑒別。