鑒別灰指甲與指甲營養不良，灰指甲主般先從一至兩個指甲開始逐浙蔓延，指甲營養不良一般是所有的指甲均有癥狀。
指甲營養不良為所有的指(趾)甲甲板均變薄，表面有表淺細小線紋、縱嵴，尤于被砂皮紙搽過。指甲無光澤，呈乳白色渾濁，指甲質脆易碎，游離緣可分離、層狀松懈，有切跡。指甲有很多縱嵴是本癥的特征，指甲下及指甲周無改變。多見于18個月～18歲兒童，成人時消退，故開始被稱為兒童指甲營養不良。但本病也發生于青年及成年人，故現在稱為指甲營養不良。其病因不明，可以是特發性的，部分可能是斑禿、銀屑病、扁平苔蘚、濕疹、灰指甲病的表現。但無皮膚、毛發、牙齒及口腔粘膜的病變。