門靜脈高壓癥形成后，可以發生以下病理變化。
1.脾腫大、脾功能亢進門靜脈血流受阻后，首先出現充血性脾腫大。門靜脈高壓癥時可見脾竇擴張，脾內纖維組織增生，單核吞噬細胞增生和吞噬紅細胞現象。臨床上除有脾腫大外，還有血細胞減少，最常見的是白細胞和血小板減少，稱為脾功能亢進。
2.交通支擴張由于正常的肝內門靜脈通路受租，門靜脈又無靜脈瓣，上述的四個交通支大量開放，并擴張、扭曲形成靜脈曲張。
3.腹水門靜脈壓力升高，使門靜脈系統毛細血管床的濾過壓增加，同時肝硬化引起的低蛋白血癥，血漿膠體滲透壓下降及淋巴液生成增加，促使液體從肝表面、腸漿膜面漏入腹腔而形成腹水。門靜脈高壓癥時雖然靜脈內血流量增加，但中心血流量卻是降低的，繼發刺激醛固酮分泌過多，導致鈉、水潴留而加劇腹水形成。