肛門瘙癢癥因為寄生蟲感染、衛生、飲食習慣不良所引起外，肛門瘙癢癥的病患還可能是因為罹患痔瘡、便秘、肛裂、病毒性感染、性傳染病等等，所以不要因為只是肛門瘙癢而不重視，反而延誤真正疾病的治療。
治療肛門瘙癢有以下四種：
一、針灸療法
針刺長強、三陰交、血海、足三里、合谷等穴;
二、注射療法
將藥物注射到皮內或皮下，破壞感覺神經，使局部失去知覺，也就感覺不到發癢了，約有半數患者可用此法治愈。采用肛周點狀注射到瘙癢區，切勿注射到肌肉層，免引起壞死，破壞運動神經，會出現一時性肛門失禁，但可以自然恢復。
三、藥物療法
1、口服藥法：根據不同原因，合理用藥。如精神緊張，神經衰弱引起，晚間可服用鎮靜催眠藥，如魯米那、安定等;如過敏引起，可選用撲爾敏、苯海拉明、息斯敏等;祖國醫學認為肛門瘙癢多與濕熱有關，應用龍膽瀉肝湯加味，達到清熱消風，通使瀉火的目的;滲出液較多、疼痛、肛門下墜、夜臥不安者，可采用消風散加減，有清熱利濕、祛風止痛之功效。
2、外敷法：采用中西藥物直接涂敷病灶區能止癢。
四、手術療法
對頑固性瘙癢癥，通過手術將肛周皮膚下感覺神經末梢切斷，達到止癢的目的。手術方式很多，有橢圓形皮膚切除縫合法、皮瓣移植法、感覺神經末梢切斷法、肛周皮下分離法等。要在局麻下，在肛門兩側各作一月牙形切口，向肛門皮下潛行解剖，在外括約肌皮下部切斷感覺神經末梢。最后將皮膚復位縫合，要止血完善，防止血腫和感染。