甲狀腺癌大約占所有癌癥的1%，在地方性結節性甲狀腺腫流行，甲狀腺癌特別是低分化甲狀腺癌的發病率也很高。據國際癌癥學會資料統計，各國甲狀腺癌的發病率逐年增加。
1、電離輻射
是甲狀腺癌的一個重要病因，放射線致癌與放射方式有關。直到目前，放射線致癌大都發生于X線外照射后。如日本原子彈爆炸及切爾諾貝利核電站事故均造成甲狀腺腫瘤發病率明顯增加。而且，需要注意的是，甲狀腺癌的危險性隨接受輻射的年齡增加而降低，即幼兒較成人的危險性高。被照射的小兒年齡愈小，發生癌的危險度愈高。另外，女性一般較男性為高。
2、碘
甲狀腺癌不僅在缺碘地區較多發，沿海高碘地區亦較常發生。
3、性別與雌性激素
甲狀腺癌發病性別差異較大，女性明顯高于男性。雌激素可以影響甲狀腺的生長，其過高也可能是致癌因素之一。
4、家族因素
在一些甲狀腺癌患者中，尤其是甲狀腺髓樣癌，常可見到一個家庭中一個以上成員同時患上甲狀腺髓樣癌。