霍亂的病程潛伏期約為1～3天，短者數小時，長者5～6天。典型患者多急驟起病，少數病例病前1～2天有頭昏、倦怠、腹脹及輕度腹瀉等前驅癥狀。按病程分為三期，治療霍亂中醫以辨證論治的方法。
一、瀉吐期
1、暑熱證
治法清熱避穢法，方用《霍亂論》黃芩定亂湯加減。黃芩15克，黃連9～15克，蒲公英30克，姜半夏9克，吳萸3克，滑石30克。加減法轉筋者加木瓜12克，白芍15克，口渴重去姜半夏加天花粉15克。成藥：玉樞丹(紫金片)，有嘔吐者先服此丹1.5克，服后嘔吐稍止，再服湯藥。
2、暑濕證
治法芳香化濁，溫運中陽法，方用霍香正氣散加減。霍香12克，姜半夏9克，陳皮9皮，茯芩9克，厚樸1克，黃連6～9克，吳萸3克。成藥霍香正氣水(丸)，每次2瓶(6克)日報2至3次。
二、脫水虛脫期
1、氣陰兩虛證
治氣陰雙補、扶正驅邪法。方用生脈散加減或急救回陽湯。黨參30克，麥冬15克，五味子15克，黃連6克(馬尾連18克)，白芍15克，灸甘草10克。
2、心陽衰竭證
治法以溫運中陽，活血祛淤法。方用《傷寒論》附子理中湯中減。黨參30克，附子15克，干姜15克，甘草15克，焦白術15克，蔥白三根，黃連9克，桂枝9克。加減法為紫紺重，加當歸15克，川芎9克。
三、反應期
治法以清熱扶正法?？捎谩稖責峤浘暋非迨钜鏆鉁訙p。太子參12克，麥冬9克，竹葉9克，石斛9克，烏梅9克，荷葉12克，西瓜皮二塊。加減熱重，加生石膏30克。小便不利加茯芩9克，食飲不振，加焦三仙30克。