肛裂癥狀有明確特點，只要詳細訊問病史病程，以及疼痛、出血特點，診斷并不困難。但在診斷時，為了提高診斷的準確性，防止失誤，應嚴格按問診、觸診、視診及活體組織病理檢查幾個方面加以鑒別診斷。肛裂不宜指檢，因為容易導致劇烈疼痛，出血等。

痔瘡與肛裂的區分鑒別

肛裂多數伴有哨兵痔，特別是被長期忽視肛裂病癥的患者，發展為陳舊性肛裂后，常同時伴有外痔、內痔，這時兩者在肛門外的表征基本相同。所以，了解肛裂和痔瘡的區別，提高肛腸異常的警惕意識對治療大有裨益。

肛裂是以肛管皮膚裂口，肛管潰瘍，難以愈合為主要表現。痔瘡則是由于肛門周圍靜脈形成靜脈曲張、靜脈血管團，以及直腸下端粘膜滑動而形成的。肛裂以疼痛、便血為主。痔瘡以出血為主，只有外痔發炎腫脹時，痔瘡才會劇痛。

肛裂可見肛管皮膚裂開，而痔瘡則無。在肛門指診時，即可確定，但肛裂者多不可行肛門指診，或者窺器檢查;肛裂多伴有肛乳頭肥大、肛乳頭瘤，而痔瘡則不伴有肛乳頭肥大或乳頭瘤;肛裂者，肛門外觀可見狹窄，而痔瘡患者則多見內痔脫出、外翻。

肛裂與肛門皸裂的鑒別

肛門皸裂是易與肛裂相混淆的一種病，皸裂發生在肛腺和肛管處皮膚的淺表開裂，裂口可發生在肛管的任何部位，多呈淺表，局限于皮下，不涉及到肌層，且裂口幾處同時存在，不用牽開肛門即可見到。而肛裂多1～2個裂口，在肛管處發生，持續性劇痛，常可深達肌層。在治療方面，肛門皸裂以外用藥物治療為主，肛裂則以手術治療為主。

肛裂與克隆氏病的鑒別

克隆氏病為并發于肛門周圍膿腫、肛瘺、肛裂、肛門潰瘍和皮贅等肛門周圍的疾患，而以并發肛裂的機率最多，近達50%。肛裂新鮮者可見裂口整齊，深淺不一，多為一個或二個裂口，出鮮血甚或點滴而出。慢性者多呈潰瘍面，有少量分泌物，裂口灰白色，有增生組織，質韌。而此期肛裂，可見肛裂三聯癥，乳頭肥大，肛裂，哨兵痔。克隆氏病在肛門緣的表現為，裂口較深，邊緣潛行，有時兩個裂口的潛行邊緣相互溝通，上面的皮膚形成皮橋，裂口周圍青紫色。肛裂可發生在肛周的任何部位，其裂口疼痛較輕，可伴有皮贅、潰瘍或瘺管。病程較長，慢性難治。

肛裂可有一個或幾個裂口存在，但多數肛裂發生在正中線上，正前或正后，即截石位6點、12點處。由于糞便干結，通過肛門時擦傷肛管皮膚，一般不能稱之為肛裂。由于糞便干硬，硬性通過肛管時，把肛管撕裂而成的傷口，才稱之為肛裂。其損傷的深度各不相同。肛裂淺則只裂傷肛管皮膚，深則可損傷皮下組織至肌肉組織，甚至損傷肌肉組織。須與結核性潰瘍、梅毒潰瘍、軟下疳和上皮癌等潰瘍相鑒別。其中潰瘍性結腸炎和肉芽腫性結腸炎并發之肛裂極易鑒別。