月經不調的原因有兩大類：一是神經內分泌功能失調引起的月經不調：主要是下后腦--卵巢軸的功能不穩定或是有缺陷，即月經病。 二是器質病變或藥物等引起的月經不調：包括生殖器官局部的炎癥、腫瘤比如子宮內膜異位、子宮發育不全、急慢性盆腔炎、子宮肌瘤等，服用內分泌制劑或采用宮內節育器避孕等等。
很多女性因月經不調到醫院就診時，大部分醫生總是習慣性的讓她們查個尿HCG，如果孕檢陰性，則再讓其服用或注射黃體酮，而有一些醫生則建議她們查個B超、內分泌等項目，為此，很多女性很不能理解，認為月經不調只是小事一樁，用得著檢查這么多項目嗎?習慣性的認為是醫生在賺取檢查費，其實不然，很多女性恰恰因此拒絕檢查而耽誤了自己的病情。
B超檢查可以反映子宮卵巢及盆腔情況，從而排除許多婦科疾病引起月經不調的可能性。
內分泌功能失調是引起月經不調的主要原因。內分泌失調就是是女性性激素紊亂，通常檢查內分泌就是通過血液檢查女性性激素分泌是否處于相對正常的水平。內分泌檢查的項目非常多，婦科內分泌檢查有六種性激素，分別是泌乳素、卵泡生成素、促黃體生成素、雌二醇、孕酮、睪酮，根據不同情況，某些患者可以不用檢查孕激素。
溫馨提示：平時做到這些事，可以幫助治療月經不調
1.請養成運動習慣，運動可以增強體力，促進血循，并可減少服藥時間。
2.在水上活動或一般運動后，請速擦干身體著衣，勿貪涼吹風;若不慎淋雨應盡速吹干頭發及換衣保暖;月經期間應避免水上活動。
3.日常作息——不要熬夜，以免影響生理節律及內分泌協調性。
4.情緒保持平和，緊張焦慮也會使卵巢功能紊亂。