垂體腺瘤是常見的顱內良性腫瘤，發病率位居顱內腫瘤第三位，垂體腺瘤很容易和其他疾病想混淆，造成錯斷誤診的現象在臨床上也比較多見。
一、顱咽管瘤
分鞍上型、鞍內型和啞鈴型(鞍上、鞍內均受累)。此病以兒童及青少年多見，可表現為垂體前葉功能減退，視力、視野障礙等類似于垂體無功能瘤的表現。但影像學上，顱咽管瘤大多為囊性，實質部分可有鈣化。病理學可確診。
二、空泡蝶鞍綜合征
多見于肥胖女性，可引起垂體功能減退及蝶鞍擴大。但該病多數患者垂體功能正常或僅輕度受損，CT或MRI檢查可明確診斷。
三、原發靶腺疾病
如原發性甲狀腺功能減退癥和原發性性腺功能減退癥。患者雖有相應的臨床表現，但相應垂體促激素水平增高，除受累靶腺外其他靶腺激素及促激素水平正常，影像學檢查無占位病變。
判斷臨床癥狀上需注意的是，部分原發甲減患者由于分泌TSH細胞增生可形成類似瘤樣改變而易被誤診為垂體腺瘤，仔細詢問病史，詳細的體格檢查和實驗室檢查可以鑒別。