長期發熱病因診斷是臨床醫生尤其是內科醫生的難題之一，對于不同國家的內科醫生來講，這始終是一個世界性的難題，據統計，目前臨床上仍然有10%左右的FUO患者最終不能明確病因。
FUO是指發熱持續2周或2周以上，體溫多次超過38.3℃，經至少l周完整的病史詢問、體檢和常規實驗室檢查不能確診的病例。
長期發熱的患者 盡管其診斷困難，但還是有診斷方法可循的。多數資料表明，在臨床上，主要有三大類不明原因發熱疾病的診斷檢查方法：
1. 感染性疾病。最多見，常需要血液、尿液、糞便、痰液等以及骨髓液等病原體的培養。結核菌素試驗、肥達反應、外斐試驗，嗜異凝集試驗、冷凝集試驗，咽試子以及血液、糞涂片查寄生蟲卵等都是常用的檢查方法。此外，影像學檢查如x-線、CT等也是診斷感染部位的常用措施之一。
2. 結締組織疾病。常有的檢查方法是：多種自身抗體，多種風濕及類風濕因子，血清蛋白電泳，體液免疫及細胞免疫功能檢查;皮膚、肌肉或肌電圖等相關檢查。
3.血液系統疾病。如惡性組織細胞病、白血病、淋巴瘤等，多可有長期發熱的臨床表現，通過血常規、骨髓常規、染色體、融合基因、病理學檢查多可確診。
4. 其它腫瘤性疾病：同位素掃描以及CT等影像學檢查;支氣管鏡、胃鏡、腸鏡等內鏡檢查;腫瘤標記物的檢查等。
多數臨床總結表明，FUO常有四大類病因：感染性發熱占首位，如細菌、病毒以及結核(特別是肺外結核)，第二位是結締組織病性如SLE、成年人Still病等，第三位是腫瘤性疾病如惡性淋巴瘤等，這三種疾病大約占FUO的90%左右。此外，尚有10%左右為其他疾病及病因不明者。
因此，長期發熱的診斷，需要根據詳細的病史資料、詳細體的格檢查資料以及必要的相關臨床線索，然后進行有目的常規檢查，這些都是重要的診斷手段。此外，盡早到正規醫院、盡早作規范的檢查、規范的治療也是能否得到成功診治的重要因素之一。