結腸慢傳輸型便秘：影像學或實驗室檢查提示有全胃腸或結腸通過時間延緩或結腸動力低下。
出口梗阻型便秘：除外直腸、肛門器質性病變(腫瘤、炎癥) 導致的排便或解剖結構異常，無嚴重的精神心理障礙，全胃腸道或結腸轉運正常，肛門直腸動力學檢測或排糞造影、恥骨直腸肌電圖顯示功能異常(肛門內括約肌功能障礙、盆底肌失協調)。
混合型便秘：具有上述兩種便秘結腸及肛門、直腸的動力學障礙特點。
IBS便秘型是一種特殊類型的便秘，具有獨立的診斷標準。即IBS羅馬II標準：在過去的12個月中至少12 周(不一定連續)具有腹痛或腹部不適癥狀，伴有以下3條中的2條者：排便后上述癥狀消失;上述癥狀出現時伴有排便次數改變;或③伴有糞便性狀改變。排便異常至少在1/ 4的發作天數內具有下述癥狀2項或3項以上者：排便每周< 3 次;糞便呈塊狀或硬結; 排便時費力、排便不盡感;無稀便或排便緊迫感。