慢性扁桃體炎多由急性扁桃體炎反復發作或因扁桃體隱窩引流不暢，窩內細菌、病毒滋生感染而演變來。這些積存的細菌不斷分泌毒素，并經過腺窩周圍的血管網傳播到全身。因而扁桃體成為不少全身性疾病如風濕熱、腎炎等的病灶，這也正是其危害所在。病源菌以鏈球菌及葡萄球菌等最常見。臨床表現為經常咽部不適，異物感，發干、癢，刺激性咳嗽，口臭等癥狀。
根據病史、局部檢查及實驗室檢查。一般依據是：(1)有急性扁桃體炎反復發作史;(2)扁桃體及舌腭弓慢性充血;(3)扁桃體表面不平，有瘢痕或黃白點狀物，擠壓時有分泌物從隱窩口排出。
慢性扁桃體炎已引起全身并發癥時，血清中甲種，丙種球蛋白與粘蛋白多異常增高，而反應性蛋白檢查多為陽性，抗鏈球菌溶血素“O”之效價增高，血沉亦多加快醫學教`育網搜集整理。通過免疫組織化學檢查，氨基酸定量，血清中α2蛋白高價，對病灶性扁桃體炎有重要意義。利用電子顯微鏡和血清熒光抗體檢查，在扁桃體組織切片中，確定出扁桃體形成的質量變化(IgG占優勢)，如能確定這種變化主要位于隱窩-淋巴間質內(后者在正常情況下沒有這種功能)，就有充分依據證明在腭扁桃體內有潛在性或活動性病灶存在。