灰指甲是甲最常見疾病，占甲病半數以上。本病指趾甲均可發生，而趾甲尤為多見。所謂病因即是指疾病發生的原因和條件，據此又可將病因分為致病因素和誘因兩種。
灰指甲的致病因素
灰指甲致病因素明確，真菌感染是其根本病因。致病菌主要可分為以下幾類：
皮膚癬菌
皮膚癬菌包括紅色毛癬菌、須癬癬菌、絮狀表皮癬菌、犬小孢子菌等。其中紅色毛癬菌最為常見，其他皮膚癬菌其次。
酵母菌
酵母菌中最主要是念珠菌、馬拉色菌，其他如光滑念珠菌、近平滑念珠菌也可致病。
非皮膚癬菌性真菌
柱頂孢霉、曲霉、青霉、短帚霉、鏈格孢霉、鐮刀菌等絲狀真菌亦可致病。
灰指甲的誘因
疾病誘因相對復雜。糖尿病等可造成局部血液及淋巴回流障礙的疾病及免疫低下等均易導致病人患病。甲損傷及其他甲病為誘發因素，特別是美甲時對甲板及甲小皮的損傷常為致病菌的入口。