引起指甲改變的原因有很多，不能認為指甲有病都是甲真菌病。但有一點應掌握，即甲真菌病的發病往往從一個指甲開始，而后逐漸波及其他指甲。如果十個手指甲或腳趾甲同時發病，則往往是全身性疾病的一種表現，需要迅速徹查身體。
灰指甲的原因
1、甲混濁：真菌侵入甲板或甲床后，由于少量的菌絲和孢子的繁衍，安慰角質物少量的堆積而使甲板變得混濁，不通明，故甲真菌病俗稱為灰指甲。
2、甲增厚：真菌侵入甲板或甲床后，甲板中的角質物遭到真菌的作用而高度增殖，角質物的堆積使甲板增厚。甲板的增厚又減輕了混濁，它可以比正常甲板厚出2～3倍以上。
3、甲外表凹凸不平：由于甲板或甲板下有角質物堆積，同時甲板又被毀壞，使甲板外表粗糙，凹凸不平，得到光澤。這種凹凸不平既為縱向，也可以為橫向。同時也可以了解為病甲的次要病變在甲板下。
4、甲板變脆易碎：由于真菌侵入甲板和甲床，在角質溶解酶的作用下，角質蛋白被溶解，構成角質粗大顆粒，被毀壞的甲板缺乏彈性和韌性而變脆，角質顆粒呈粉末狀易于零落、松懈而變得碎雜。