病毒性肝炎的診斷，要依據流行病學、癥狀、體征及實驗室檢查，結合病人具體情況及動態變化進行綜合分析。必要時可做肝活體組織檢查。
病毒性肝炎的命名應包括病名、病原學分型及臨床分型，例如：病毒性肝炎、甲型、急性黃疸型。病毒性肝炎、乙型、亞急性重型。病毒性肝炎、HBsAg(-)、慢性遷延型。
一、病原學分型
(一)甲型
1.急性期肝炎患者血清抗-HAVIgM陽性者。2.急性期、恢復期雙份血清抗-HAVIgG效價呈4倍以上升高者。
3.急性期早期糞便抗-HAV免疫電鏡查到HAV顆粒者。
4.急性期早期糞便中查到HAAg者。
以上四項中任何一項陽性就可確診。
(二)乙型
1.血清HBsAg陽性或伴HBcAg陽性者。
2.血清HBsAg陰性，但抗-HBcIgM陽性，或抗-HBs或抗-HBc陽性者。
3.血清HBV-DNA或DNA多聚酶或HBcAg或抗HBc陽性者。
4.HBV感染指標不明顯或只有抗-HBc一項指標陽性，肝內HBcAg、HBsAg或HBV、DNA陽性者。
以上四項中任何一項陽性就可診斷為乙型肝炎病毒感染。
至于急性乙型肝炎的診斷，由于我國無癥狀HBsAg攜帶者很多，這些人如再感染非甲非乙型肝炎或其他急性肝炎，極易誤診為急性乙型肝炎，因此需仔細鑒別，特別是進行科研時對急性乙型肝炎的確診更要慎重，一般可參考以下幾點：
(1)發病不久，經靈敏的方法檢測HBsAg陰性，發病后陽轉，且滴度較高者。
(2)急性期血清抗-HBcIgM的高滴度，抗-HBcIgG低滴度，恢復期恰恰相反者。
(3)急性期HBsAg高滴度，恢復期持續陰轉者。
(4)急性期抗-HBc陽轉或恢復期抗-HBs陽轉者。
(5)有明確的受染者(如輸入HBsAg陽性血液)，且潛伏期符合，發病后HBsAg陽性者。
慢性肝炎的病原學確診更難，一般分為HBsAg陽性和HBsAg陰性即可。無癥狀HBsAg攜帶者：無任何臨床癥狀及體征、肝功能正常、HBsAg血癥持續陽性6個月以上者。
(三)非甲非乙型
1.凡不符合急性甲、乙型肝炎病原學診斷指標，并排除巨細胞病毒EB病毒感染等(無特異性IgM抗體)及其他已知原因之肝炎，如藥物性肝炎者，可診為急性非甲非乙型肝炎。
2.凡慢性肝炎患者HRV感染指征全部陰性，并排除自身免疫性肝炎及其他已知原因之肝炎者，可診為慢性非甲非乙型肝炎。
3.凡呈水源、食物暴發流行特征，又不符合甲型肝炎病原學診斷標準者，可診為流行性非甲非乙型肝炎。
甲、乙、非甲非乙型肝炎可合并感染，亦可重疊感染，故在病原診斷時應認真辨別。
二、臨床分型
(一)急性肝炎
1.急性黃疸型。
2.急性無黃疸型。
(二)慢性肝炎
1.慢性遷延性。
2.慢性活動性。
(三)重型肝炎
1.急性重型。
2.亞急性重型。
(四)淤膽型肝炎。
三、各臨床型的診斷依據
(一)急性肝炎
1.急性無黃疸型肝炎
應根據流行病學資料、癥狀、體征、化驗及病原學檢測綜合判斷，并排除其他疾患。
(1)流行病學資料
密切接觸史指與確診病毒性肝炎病人(特別是急性期)同吃、同住、同生活或經常接觸肝炎病毒污染物(如血液、糞便)而未采取防護措施者。注射史指在半年內曾接受輸血、血液制品及消毒不嚴格的藥物注射、免疫接種、針刺治療等。
(2)癥狀
指近期內出現的持續幾天以上的，無其他原因可解釋的癥狀，如乏力、食欲減退、惡心、厭油、腹脹、溏便、肝區痛等。小兒尚多見惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉、精神不振、懶動，常有發熱。
(3)體征
指肝腫大且有動態性變化并有壓痛，部分病人可有輕度脾腫大。小兒肝大較明顯，脾大較多見。
(4)化驗
主要是血清谷丙轉氨酶活性增高。
(5)病原學檢測
見前。
凡流行病學資料、癥狀、體征、化驗四項中三項明顯陽性(應包括化驗陽性)或化驗及體征(或化驗及癥狀)均明顯陽性，并排除其他疾病者可確診。
凡近期內單項血清谷丙轉氨酶增高，或僅有癥狀、體征，或僅有流行病學史及(2)、(3)二項中一項，均為可疑者。對可疑者，應進行動態觀察或結合其他檢查(包括肝活體組織檢查)做出診斷。可疑者如病原學診斷為陽性且除外其他疾病者可以確診。
2.急性黃疸型肝炎
凡急性發病，具有不同程度的肝炎癥狀、體征及化驗異常，血清膽紅素在1.Omg/dl以上，尿膽紅素陽性，并排除其他原因引起之黃疸，可診斷為急性黃疸型肝炎。
(二)慢性肝炎
1.慢性遷延性肝炎(慢遷肝)
有確診或可疑急性肝炎的病史 (有時不明確)，病程超過半年尚未痊愈，病情較輕，可有肝區痛和乏力，伴有血清轉氨酶升高或輕度肝功能損害，而不夠診斷慢活肝者，或肝活體組織檢查符合慢遷肝的組織學改變者，皆可診為慢遷肝。2.慢性活動性肝炎(慢活肝)
(1)癥狀
既往有肝炎史(有時不明確)，目前有較明顯的肝炎癥狀，如乏力、食欲差、腹脹、溏便等。
(2)體征
肝腫大，質地中等硬度以上，可伴有黃疸、蜘蛛痣、肝病面容、肝掌或脾腫大，而排除其他原因者。
(3)實驗室檢查
血清谷丙轉氨酶活力反復或持續升高伴有濁度試驗(麝濁、鋅濁)長期明顯異常，或血漿白蛋白減低，或白/球蛋白比例明顯異常，或丙種球蛋白明顯增高，或血清膽紅素長期或反復增高。
(4)肝外器官表現
如關節炎、腎炎、脈管炎、皮疹或干燥綜合征等，其中以腎炎較多見。以上四項中有三項為陽性，或第(2)、(3)兩項為陽性，或肝活體組織檢查符合慢活肝的組織學改變者，皆可診斷為慢性活動性肝炎。
慢活肝的重型
表現同亞急性重型肝炎，但有慢活肝的病史、體征及嚴重肝功能損害。
慢遷肝及慢活肝的鑒別有時十分困難，必要時應進行肝組織學檢查。