非淋菌性尿道炎若是不及時治療，在男性可能會出現附睪炎一般發生急性尿道炎后，同時發生附睪炎，以單側附睪炎居多。患者在臨床上還會出現有低熱，附睪腫大疼痛，同側腹股溝和下腹部有反射抽痛等癥狀。發病初期與睪丸界限清楚，漸漸不清，睪丸觸痛，腫大，劇烈觸痛。尿液?；鞚?。同時可有前列腺炎和精囊炎。
1、在臨床上，人們一般認為非淋菌性尿道炎是由支原體和衣原體所引起，其他的病原體可有念珠菌、陰道毛滴蟲、單純皰疹病毒、包皮桿菌、蘭氏鞭毛蟲，細菌感染也是非淋菌性尿道炎的病因之一，國外報道有一部分非淋菌性尿道炎患者可以分離到解鳥類桿菌、流感嗜血桿菌、副流感桿菌、不動桿菌、綠膿桿菌、腐生葡萄球菌等。
2、還有很多人認為非淋菌性尿道炎是由于長期使用抗生素，導致菌群失調而發病。
3、非淋菌性尿道炎還與人們的房事不潔有關，直接或間接感受特殊的穢濁之邪釀成濕熱，濕熱毒邪博結，侵犯下焦，流注膀胱，熏灼尿道，而使膀胱氣化失司，水道不利，尿道阻塞有關?；蛞蚋斡魵鉁站枚?，下侵膀胱，負氣化不行，水道不利而為淋。
4、在中醫認為，非淋菌性尿道炎或許還會因房勞傷腎或濕熱毒邪由腑上逆至臟，傷及腎氣，久病傷脾胃，脾腎虧虛，氣化，不能攝納脂膏而淋濁。病情日久則久淋體虛，勞傷過度，或藥毒所傷，損陰耗氣以致脾腎虧虛，膀胱氣化無權，濕邪久戀所致。