非淋菌性尿道炎是由性接觸傳染的一種尿道炎，但在尿道分泌物中查不到淋球菌。女性還有子宮頸炎等生殖道的炎癥。病原體多為衣原體，支原體、滴蟲、皰疹病毒、念球菌、而衣原體、支原體的感染占80%以上。尿道炎可分為兩類，淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎。前者是指淋病雙球菌致成的尿道炎，也秒為特異性尿道炎。而后者則指的是淋病雙球菌以外的其它微生物所致的尿道炎，也稱為非特異性尿道炎。這類尿道炎中，已知其病原體的，則稱為真菌性尿道炎和滴蟲性尿道炎等，而不再包括在非淋菌性或非特異性尿道炎之內。目前，通常被稱為非淋菌性尿道炎的是指衣原體(占40%-50%)、支原體(占20%-30%)及一些尚不明致病病原體的尿道炎。
非淋菌性尿道炎雖然癥狀較淋病輕，但危害并不比淋病輕。由于癥狀較輕，很多患者失去了治療的最佳時期，從而使治療非常困難，本病尤其在女性中癥狀極其輕微，而女性感染者由于癥狀輕微往往不予治療，增加了本病傳播的機會。本病除引起尿道炎外，在女性約一半以上的患者有合并癥，如：急慢性輸卵管炎、異位妊娠、不育、流產、死胎。而男性則會引起：附睪炎、前列腺炎、精囊炎、性功能障礙。