體格檢查
對每一個嘔吐的新生兒都應該進行全面的體格檢查，觀察有無全身感染的體征，神經系統疾病的征象和代謝性疾病的跡象，重點應注意腹部和神經系統體征。 輔助檢查:
(1)鼻胃管檢查
是一種簡單有效的檢查上消化道畸形的方法。當遇到母親羊水過多，或出生后短期內嬰兒出現口吐螃蟹樣泡沫時，應該在產房內下鼻胃管檢查，正常時鼻胃管能夠順利進入胃內，并抽出少量液體，如鼻胃管下降受阻或從口腔或鼻腔內折返回來，提示食管閉鎖
(2)X線檢查
①腹部透視和攝片
腹部透視和攝片是新生兒嘔吐時最常用的診斷方法，為了更好地觀察脹氣的腸曲和液平，應該采用立位透視和攝片，也可以采用側位水平投照法攝片。
②鋇餐或鋇灌腸檢查
可以觀察食管、胃和腸道的形態和功能，對消化道疾道德敗壞的診斷有重要價值，疑有胃腸道完全性梗阻或穿孔的新生兒，禁用鋇劑造影，疑有食管閉鎖或食管氣管瘺者可用水溶性碘劑造影，并于造影后及時將造影劑吸出。
③超聲檢查
超聲檢查對腹水的探查、腹部腫物部位和性質的診斷、腹腔內游離氣體的存在等，都具有很高的敏感性和特異性，對膽總管囊腫、腎上腺皮質增生癥、新生兒壞死性小腸結腸炎等疾病的診斷方面都優于X線檢查。現在，肥大性幽門狹窄的超聲檢查已經基本取代了鋇餐檢查。超聲檢查不僅可以觀察到胃腸道的某些改變，而且能直接觀察肝膽系統、泌尿系統、循環系統等改變及其對消化道的影響，對嘔吐病因的診斷有很大幫助。
④胃鏡
新生兒常需在全身麻醉下進行，臨床應用較少。胃鏡檢查可以對粘膜充血、出血、水腫、潰瘍、瘢痕、腫瘤和先天畸形等情況進行直接的觀察，對某些食管、胃部疾病具有確診意義。