胃食管反流病的臨床表現多樣，輕重不一，有些癥狀較典型，如燒心和反酸，有些癥狀則不易被認識，從而忽略了對本病的診治。不少患者呈慢性復發的病程。
燒心和反酸
是胃食管反流病最常見癥狀。燒心是指胸骨后或劍突下燒灼感，常由胸骨下段向上伸延。常在餐后1小時出現，臥位、彎腰或腹壓增高時可加重。胃內容物在無惡心和不用力的情況下涌入口腔統稱為反胃。本病反流物多呈酸性，此時稱為反酸。反酸常伴有燒心。
吞咽困難和吞咽痛
部分患者有吞咽困難，可能是由于食管痙攣或功能紊亂，癥狀呈間歇性，近視固體或液體食物均可發生。少部分患者吞咽困難是由食管狹窄引起，此時吞咽困難可呈持續性進行性加重。有嚴重食管炎或并發食管潰瘍，可伴吞咽疼痛。
胸骨后痛
疼痛發生胸骨后或劍突下。嚴重時可為劇烈刺痛，可放射到后背、胸部、肩部、頸部、耳，此時酷似心絞痛。多數患者由燒心發展而來，但亦有部分患者可不伴游有關胃食管反流病的燒心和反酸的典型癥狀，給診斷帶來困難。
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