1、早期預防
由于恒牙的形成、生長和發育是在胚胎期和兒童期完成的，因此，在兒童期要做好牙病預防，少食精制的甜食，每日刷牙2～3次。一旦發現牙病要及時治療。
2、早期檢查
在換牙期間，家長要仔細觀察孩子口腔內有無畸形牙，到期該換的牙齒是否按期萌出，鄰近未萌出牙的牙齒有無傾斜、移位等。如發現疑點，要及時帶孩子到醫院就診。拍一張口腔全景x線片，了解所有牙齒的位置情況。如發現恒牙在頜骨內有倒生、水平阻生、移位或恒牙被鄰牙根阻擋不能正常萌出，應視情況及時拔除不能萌出的恒牙，并定期攝片觀察。對于有面部腫脹史、經常抗炎治療不能消除腫脹者，一定要攝片檢查，以確定頜骨內有無囊腫形成。
3、早期治療
一旦發現牙源性頜骨囊腫，應及早進行手術治療。通常囊腫較小，骨質損壞也較小，完整摘除，可減輕創傷，減小面部畸形程度，也便于恢復咀嚼功能。一般性手術的預防性抗感染選用磺胺類藥物(如復方新諾明)或主要作用于革蘭氏陽性菌的藥物(如紅霉素、青霉素等);體質差或并發感染者常聯合用藥，較常用為：作用于革蘭氏陽性菌的藥物(如青酶系)+作用于革蘭氏陰性菌的藥物(如慶大霉素)+作用于厭氧菌的藥物(如滅滴靈);手術前后感染嚴重或有并發癥者可根據臨床和藥敏試驗選擇有效的抗生素。