腰痛是腰椎結核最常見的癥狀，疼痛的性質多為鈍痛或酸痛，伴有壓痛及叩擊痛，在勞累、咳嗽、睡前疼痛加重。上腰椎結核可有大腿痛，下腰椎結核可有坐骨神經痛，這是由于結核膿腫、肉芽組織及壞死的椎間盤或死骨向后突入椎管內，使脊髓或神經根受到壓迫或刺激時，可出現放射痛。
全身癥狀
早期患者可無任何癥狀，亦可有全身不適，疲乏無力，午后低燒，食欲不振，身體消瘦等慢性消耗性表現。
腰椎活動受限：腰部生理彎曲消失，椎旁肌肉保護性痙攣，使腰部處于高度保護狀態，限制脊椎活動而減輕疼痛，這是腰椎結核早期出現的明顯體征之一。從地上拾物時，盡量屈髖屈膝直腰下蹲，而避免彎腰取物，即拾物試驗陽性。俯臥位脊柱后伸試驗亦為陽性。
脊柱畸形
當病變發展到一定程度后，由于椎體破壞塌陷與變形，導致腰椎明顯后突畸形，側突畸形極少見。隆起處多伴有明顯之壓痛及叩擊痛。
寒性膿腫
寒性膿腫對于腰椎結核的診斷有重要意義。因膿腫形成緩慢，且無急性炎癥特征，故稱為“寒性膿腫”。膿汁一般稀薄呈米湯樣，內含大量結核性肉芽組織、干酪樣物質、壞死椎間盤組織和死骨等。腰椎結核的寒性膿腫多位于一側或兩側的腰大肌，可引起腰大肌刺激癥狀，導致髖關節屈曲攣縮畸形、托馬斯征陽性;亦可沿腰大肌流注到兩側髂窩、腰三角、股三角處，膿腫破潰后，形成經久不愈的竇道。如繼發感染，則伴有急性化膿性炎癥特征。