影響腦卒中后功能恢復后果的因素很多，以偏癱為例，下列因素會對運動功能的恢復產生重要影響
1. 部位
內囊后肢影響最大，同樣大小和同樣性質的腦損害如果發生在內囊后肢，引發的偏癱最難恢復;
2. 大小
腦損傷體積的大小表明神經系統破壞的程度，破壞程度大的后果就嚴重;
3. 性質
就引發偏癱后運動功能恢復的困難程度來講，梗死>出血>栓塞;
4. 醫學處理的及時程度和正確與否
發病后及時的、正確的處理可以控制住病情的進一步加重，及時地、最大限度地保護好殘存的腦組織，甚至可以挽救一部分已經受損的神經組織(如及時溶栓可以挽救一大批因缺血而可能瀕臨死亡的神經元)，而預防和控制并發癥可以為康復處理創造極為良好的條件。反之，將會大大影響康復的同步進行。
5. 患者有嚴重的言語交流障礙
不能配合主動性康復訓練，將會嚴重影響偏癱的恢復。
6. 患者有嚴重的認知功能障礙
如重度癡呆或重度忽略，將會大大延遲運動功能的恢復。
7. 患者有嚴重的并發癥
不得不進行復雜的臨床治療，如嚴重的吸入性肺炎、泌尿系統感染，下肢深靜脈血栓，嚴重的心臟病，精神異常，嚴重的高血壓，糖尿病等，康復訓練根本不能進行。
8. 康復處理是否及時和準確
如果造成了嚴重的“廢用綜合癥”，“誤用綜合癥”或過用，偏癱患者運動的恢復就會十分困難。
9. 患者的體力活動耐受能力
在強化康復訓練時，康復醫療的有效性是有時間依賴性和劑量依賴性的。患者體力經受不了適當時間和適當劑量的康復訓練，就不能期望運動功能能快速恢復
10. 肢體軟癱的時間
一般偏癱患者肢體在2-4周后肌張力由很低而轉為升高。長期患肢肌張力低下的患者，運動功能的恢復較差。