植物神經系統在生理上由大腦皮質神經進行支配和調節。正常情況下大腦皮質的興奮、緊張交替進行，協調一致大腦是人情感、思維的主體，當外界的情志刺激因素強度過大，或持續時間過長，進而導致大腦皮質的部分區域過度興奮，統一協調功能失常，致使大腦的血管緊張痙攣，血行緩慢瘀滯，進一步導致大腦供血不足，腦細胞低氧，代謝廢物淤積，從而使大腦神經調節能力下降。
由于大腦皮質對植物神經系統的統帥作用，大腦這一人體司令部混亂常導致植物神經系統功能失調。如出現胸悶、憋氣、心慌、瀕死感等心臟神經癥;胃痛、胃脹、嘔吐、腹瀉等胃腸神經癥;其他如頭痛頭暈、失眠、健忘、皮膚發麻、皮膚發癢、痛經等各種各樣、千奇百怪的臨床癥狀。其臨床特點首先是身體沒有明顯器質性改變，其次病情加重或反復常伴隨焦慮、緊張、憂郁等情緒變化，一般按冠心病，胃炎等器質性疾病治療常無效。
植物神經功能紊亂是在諸多心理社會因素作用下產生的一系列生理心理反應，某些性格缺陷者、素質性神經衰弱者易發生本病。大腦皮質功能紊亂，植物神經興奮，抑制平衡失調亦易發生本病。采用合理有效的治療，包括藥物，心理，行為療法及物理療法，綜合治療使不少患者病情很快得到改善，經過一個階段的治療恢復了健康，重返學習，工作崗位 。
經過長期的臨床實踐，治療植物神經功能紊亂關鍵在于建立信心，順應自然，接受現實，正確對待實際生活中的挫折與病痛，發揮個人優勢，克服性格弱點，振作精神，適當尋求解脫方式，尋求社會心理支持，保持生活規律及足夠的睡眠，適當參加一些體育鍛煉，娛樂與休閑，一般說，來經過2～3個月的生理、心理調適及合理用藥，綜合治療植物神經功能紊亂是完全可以恢復的 。