治療硬化癥曾試用過多種免疫調節藥，僅少數藥物如硫唑嘌呤和環磷酰胺有效，另外對一小部分患者給予全身淋巴放射治療似乎能改善部分病情。這些治療方法能改善臨床癥狀支持MS的CNS損傷的機制是自身免疫過程的學說。然而，長期免疫抑制藥應用的危險性，如癌變大大限制了這類藥物的廣泛應用。
在英國和荷蘭硫唑嘌呤治療硬化癥的詳細試驗研究說明該藥對MS無顯著療效。據一MS研究小組報道，在疾病的慢性、進展期，經過2年潑尼松(強的松)和環磷酰胺治療能夠延遲病情的惡化，他們也同時指出應注意這種治療給患者帶來的負擔和潛在的毒性作用。至少有一項雙盲、安慰-對照研究結果顯示環磷酰胺沒有任何療效。
有兩種新的治療方法有希望改變MS的自然病程。初期臨床試驗表明，皮下注射干擾素(β-干擾素)能降低MS復發的頻率和嚴重程度，減少了MS病灶數目。有證據說明干擾素(β-干擾素)能降低大腦半球脫髓鞘改變。該藥能否阻遏神經功能障礙的進展有待進一步驗證。然而，臨床療效并不令人振奮。Bornstein等也報道了MBP多聚體和復合多聚體I(Cop I)對復發緩解型MS有效。這種藥物尚待FAD批準。對新近通過口服牛髓鞘使髓鞘脫敏的試驗尚未得出結論。