手汗癥手術會出現術中出血、心臟驟停等一系列的并發癥，如果能夠對這些并發癥有所了解，并在并發癥發生之前給予相應的防范，可以極大限度的避免或減輕并發癥給患者帶來的危害。
術中出血
術中出血通常是分離胸交感神經鏈時來自肋間靜脈或奇靜脈屬支的損傷，一旦出血，切不可慌亂盲目燒灼電凝，應立即用內鏡鉗鉗夾電凝止血，或夾取小紗布球壓迫止血，一般均可成功。
心臟驟停
在做左側交感神經鏈切斷手術時，因為該側是心臟支配的優勢側，切斷后可能對心率有一定的影響，故手術應先在右側施行。手術時應高度注意患者的心率(律)及血壓的變化。
氣胸
高達75%的手術病人術后胸內都有少許氣體殘留，但通常能被吸收，僅有極少數患者需安置胸引流管排氣，張力性氣胸罕見。術畢排氣時發現氣體排之不盡，應放置胸引流。
皮下氣腫
可單獨或伴隨氣胸出現，它通常出現在切口的周圍，并局限于胸部。輕度的皮下氣腫一般不需處理，但提醒注意有無合并氣胸，重度的皮下氣腫則需放置皮下引流。
肺不張或肺炎
個別患者術后X線提示節段性肺不張或肺炎，防治的要點在于鼓肺排氣、術后早期下床活動、多作深呼吸和拍背、咳痰。
術后一過性手掌多汗
多發生于術后一周內，表現為手術后手掌多汗癥狀較術前嚴重或相似，可以無任何誘因，一周后多自愈。術前應告知患者，否則他們會擔心是否是手術失敗了。